Двухместные катамараны могут применяться в различных целях, ниже приведены наиболее распространенные из них.
Чаще всего они применяются как спортивное судно, так как ими относительно легко управлять. Особенно это относится к рекам 3-4 к. с, где от экипажей четырехместных, как правило, большой работы не требуется, зато экипажи двоек имеют большие возможности для техничного сплава.
Также двухместные катамараны могут использоваться как транспортное судно. Двухместный катамаран средних размеров в походе может везти груз двух человек, составляющих данный экипаж. Обычно вес груза 40-50 кг, но двойка также может взять на борт дополнительно еще 20-30 кг груза, без последствий в ходовых способностях. Это позволяет использовать ее для сопровождения одноместного судна, или даже двухместного.
Как страховочному судну, двухместному катамарану вполне свойственно выловить и доставить на берег тонущего человека или даже одноместное судно. Однако для этого требуются определенные навыки и опыт.
В основном для обучения используются двухместные катамараны, поскольку на них легче научится управлению данным видом транспорта. Двойка имеет наибольшие преимущества именно в этой области. Обучение на четырехместных катамаранах, в отличии от двоек, малоэффективно, потому что на них новичкам тяжело уловить связь между своими действиями и движением катамарана. В результате обучение на двухместном катамаране идет намного быстрее, чем на четверках. Очень часто бывает, что выпускники школ обучения, прошедшие учебно-тренировочный поход по реке 3 к/с на двухместных катамаранах, владеют техникой управления намного лучше, чем опытные туристы с походами на реки 5 к/с на четверках.